Mar thoradh ar ionradh leanúnach an chonraitheora Spáinnigh Don Nuño Beltrán de Guzmán i dtreo thailte thiar na tíre, d’fhonn a cheannas agus a chumhacht ar na críocha sin a mhéadú, bunaíodh cúige nua darb ainm Ríocht na Galicia Nua.
Bhí grúpaí dúchasacha éagsúla ina gcónaí sa réigiún, a rinne creachadh leanúnach ar na lonnaíochtaí a bhí á mbunú ag na Spáinnigh ann. Fuair leifteanant Nuño de Guzmán, an Captaen Juan B. de Oñate orduithe chun na cúigí sin a shlánú agus an Villa de Guadalajara a bhunú san áit ar a dtugtar Nochistlán, fíric a rinne sé consummated an 5 Eanáir, 1532. I bhfianaise ionsaithe dúchasacha go minic ar an gcathair b’éigean dó bogadh bliain ina dhiaidh sin go Tonalá agus ina dhiaidh sin go Tlacotlán. Rinneadh tríú aistriú chun an baile a shocrú i nGleann Atemajac, áit ar bunaíodh an chathair go cinntitheach an 14 Feabhra 1542 le láithreacht Cristóbal de Oñate mar ghobharnóir ar Nueva Galicia agus Don Antonio de Mendoza, ansin viceroy na Spáinne Nua, a cheap méara Miguel de Ibarra agus gobharnóir.
D’fhorbair an chathair go gasta agus thosaigh sí ag dul san iomaíocht le cathair Compostela (Tepic inniu), a bhí mar shuíochán na gcumhachtaí reiligiúnacha agus sibhialta ansin, ionas gur chuir áitritheoirí Guadalajara an oiread sin brú ar údaráis Audiencia, gur chuir an rí Chinn Felipe II Cédula a eisiúint dar dáta 10 Bealtaine, 1560 chun bogadh ó Compostela go Guadalajara, an Ardeaglais, an Chúirt Ríoga agus oifigigh an Chisteáin.
Pleanáladh an struchtúr uirbeach de réir struchtúr na gcathracha coilíneacha eile, agus mar sin forbraíodh a leagan amach i bhfoirm cláir fichille ón méid a bhí i gcearnóg San Fernando. Níos déanaí bhunaigh Fray Antonio de Segovia comharsanachtaí Mexicaltzingo agus Analco, agus comharsanacht Mezquitán, ceann de na cinn is sine. Tógadh tithe halla an bhaile freisin, os coinne teampall reatha San Agustín agus an chéad séipéal paróiste ina bhfuil Pálás an Cheartais suite.
Sa lá atá inniu ann, tá roinnt mhaith samplaí ailtireachta ábhartha sa chathair iontach, atá fairsing i bhfoirgnimh choilíneacha, mar shampla a hArdeaglais, suíomh nach mór a fheiceáil, a thóg an t-ailtire Martín Casillas idir 1561 agus 1618. Rangaíodh a stíl mar bharócach incipient. Ardaíonn a struchtúr soladach os comhair Plaza de Guadalajara an lae inniu, lena túir aisteach, cé nach mbaineann siad le stíl bhunaidh an fhoirgnimh, go n-aithnítear faoi láthair iad mar shiombail de phríomhchathair Guadalajara. Scriosadh crith talún na túir primitive sa 19ú haois, agus sin an fáth gur cuireadh na cinn atá ann inniu leis. Tá an taobh istigh den teampall i stíl leath-Ghotach, lena n-áirítear a boghtaí atá déanta as lása.
Is iad maighean reiligiúnacha eile ón 16ú haois clochar San Francisco, a bunaíodh i 1542 in aice leis an abhainn, i gcomharsanacht Analco, agus a scriosadh beagnach go hiomlán san Athchóiriú. Caomhnaítear a theampall, a ndearnadh athchóiriú air ag deireadh an 17ú haois, agus a aghaidh Bharócach de línte measartha Sómónacha. Bhunaigh Ordanáis Ríoga Felipe II clochar San Agustín i 1573 agus faoi láthair caomhnaíonn sé a theampall lena éadan de línte troma Herrerianacha agus a taobh istigh le boghtaí ribeach.
Bhí mná rialta Dhoiminiceacha as Puebla i seilbh Santa María de Gracia, ceann eile de na bunchlocha coinbhinsiúin, a tógadh i 1590 os comhair an Plaza de San Agustín agus a d’íoc Hernán Gómez de la Peña as. Tháinig an tógáil chun sé bhloc a áitiú, cé nach maireann ach a theampall sa lá atá inniu ann, le éadan neoclasaiceach ón dara leath den 18ú haois.
